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20世紀80年代，醫學家們又開創了使用染色體多態性鑒定親子關系的技術，染色體多態性又稱異態性（heteromorphism），是指正常人群中常見的各種染色體形態的微小變異（如：隨體增大、重復或缺如，著比粒區的熒光強度變異等），這種多態是可以遺傳的。這項技術就是利用其形態來鑒定親子關系，這要靠技術人員的主觀判斷，其準確率也不盡如人意。